Los órganos de gobierno y participación del Colegio Mayor Cardenal Cisneros son los siguientes enumerados jerárquicamente:

1. Colegiados:

• El Patronato.
• La Comisión Directiva.
• El Consejo de Dirección.
• La Asamblea Colegial.
• El Consejo Asesor de profesores de la Universidad de Granada y Junta de gobierno de la Asociación de Antiguos Colegiales como órgano participativo.

2. Unipersonales:

• Director: D. Francisco José García Lozano

COMISIÓN DIRECTIVA: CURSO 2020-2021

•  Director:  D. Francisco José García Lozano
•  Adjunta a Dirección:  D. Antonio Fajardo Gómez de Salazar
•  Adjunto a Dirección:  Dña. Rosalía López Fernández
•  Representante de la Entidad Titular:  D. Fernando Colodro Campos
•  Representante de los Colegiales:  D. Francisco Javier Alías Carrascosa
•  Representante del P.A.S.:  D. Manuel Mata Torres

CONSEJO DE DIRECCIÓN: CURSO 2020-2021

• Director:  D. Francisco José García Lozano
• Adjunta a Dirección:  D. Antonio Fajardo Gómez de Salazar
• Adjunto a Dirección:  Dña. Rosalía López Fernández
• Decano:  Dña. Inés de Lázaro Ramírez
• Consejeros/as:  
  • Dña. María García Cabrera
  • D. José Antonio Ocaña Molinero
  • Dña. Margalida Perelló Maura
  • D. Yaser Soulman-Riffi Pou

DELEGADOS/AS

• Bibliotecario Mayor: D. Pablo López Hierro
• (Subdelegados biblioteca): D. Rodrigo Blanco Dominguez y Dña. Carmen Ferrero de Juan
• Conferencias: D. Yaser Soulman-Riffi Pouso
• (Subdelegada conferencias): Dña. María Rueda Giménez
• Cine-club: D. Álvaro Martínez Peña
• Deportes femenino: Dña. María García Cabrera
• Deportes masculino: D. Antonio Gayá Navarro
• Foto-club: D. José Alberto Gómez García
• Grupo de música: D. Jaime Moreno San Antonio
• Musical: Dña. Laura Zamorano Guerrero y D. Harún Hamed Al-Lal
• Pastoral: Dña. Inés de Lázaro Ramírez
• Teatro: D. Juan Andrés Peña Maldonado
• Tuna: D. Rafael Bermúdez Torres
• Oratoria: Dña. María García Cabrera

SUBDELEGADOS/AS

• Ajedrez: D. Antonio Camacho Ruano
• Atletismo: D. José Antonio Ocaña Molinero
• Baloncesto masculino: D. Juan Carlos García Sedano
• Baloncesto femenino: Dña. Carmen Ferrero de Juan
• Balonmano masculino: D. Manuel Juan Sélas
• Botiquín: D. Gonzalo Candón Ibáñez
• Futbol masculino: D. Mario Escolano López
• Futbol-sala masculino: D. Alejandro Velasco Fernández
• Futbol-sala femenino: Dña. Patricia Haro Sánchez
• Gimnasio: D. José Antonio Sánchez Martínez
• Juegos de Mesa: D. Luis Miguel Marmolejo Pacetti
• Paddle: D. Juan Vicente Alcalá Ríos
• Rol: D. Juan Andrés Peña Maldonado
• Rugby masculino: D. Angel Bermúdez Caballero
• Senderismo: Dña. Margalida Perelló Maura y D. Jorge Lara Abelenda
• Tenis: D. José Illana Lope
• Tenis-mesa: D. Nasar Soulman-Riffi Pou
• Voleibol femenino: Dña. María del Carmen Latorre Flores
• Voleibol masculino: D. Alejandro Cruz Merino