Los órganos de gobierno y participación del Colegio Mayor Cardenal Cisneros son los siguientes enumerados jerárquicamente:
1. Colegiados:
- El Patronato.
- La Comisión Directiva.
- El Consejo de Dirección.
- La Asamblea Colegial.
- El Consejo Asesor de profesores de la Universidad de Granada y Junta de gobierno de la Asociación de Antiguos Colegiales como órgano participativo.
2. Unipersonales:
- Director: D. Francisco José García Lozano
COMISIÓN DIRECTIVA: CURSO 2020-2021
- Director: D. Francisco José García Lozano
- Adjunta a Dirección: D. Antonio Fajardo Gómez de Salazar
- Adjunto a Dirección: Dña. Rosalía López Fernández
- Representante de la Entidad Titular: D. Fernando Colodro Campos
- Representante de los Colegiales: D. Francisco Javier Alías Carrascosa
- Representante del P.A.S.: D. Manuel Mata Torres
CONSEJO DE DIRECCIÓN: CURSO 2020-2021
- Director: D. Francisco José García Lozano
- Adjunta a Dirección: D. Antonio Fajardo Gómez de Salazar
- Adjunto a Dirección: Dña. Rosalía López Fernández
- Decano: Dña. Inés de Lázaro Ramírez
- Consejeros/as:
- Dña. María García Cabrera
- D. José Antonio Ocaña Molinero
- Dña. Margalida Perelló Maura
- D. Yaser Soulman-Riffi Pou
DELEGADOS/AS
- Bibliotecario Mayor: D. Pablo López Hierro
- (Subdelegados biblioteca): D. Rodrigo Blanco Dominguez y Dña. Carmen Ferrero de Juan
- Conferencias: D. Yaser Soulman-Riffi Pouso
- (Subdelegada conferencias): Dña. María Rueda Giménez
- Cine-club: D. Álvaro Martínez Peña
- Deportes femenino: Dña. María García Cabrera
- Deportes masculino: D. Antonio Gayá Navarro
- Foto-club: D. José Alberto Gómez García
- Grupo de música: D. Jaime Moreno San Antonio
- Musical: Dña. Laura Zamorano Guerrero y D. Harún Hamed Al-Lal
- Pastoral: Dña. Inés de Lázaro Ramírez
- Teatro: D. Juan Andrés Peña Maldonado
- Tuna: D. Rafael Bermúdez Torres
- Oratoria: Dña. María García Cabrera
SUBDELEGADOS/AS
- Ajedrez: D. Antonio Camacho Ruano
- Atletismo: D. José Antonio Ocaña Molinero
- Baloncesto masculino: D. Juan Carlos García Sedano
- Baloncesto femenino: Dña. Carmen Ferrero de Juan
- Balonmano masculino: D. Manuel Juan Sélas
- Botiquín: D. Gonzalo Candón Ibáñez
- Futbol masculino: D. Mario Escolano López
- Futbol-sala masculino: D. Alejandro Velasco Fernández
- Futbol-sala femenino: Dña. Patricia Haro Sánchez
- Gimnasio: D. José Antonio Sánchez Martínez
- Juegos de Mesa: D. Luis Miguel Marmolejo Pacetti
- Paddle: D. Juan Vicente Alcalá Ríos
- Rol: D. Juan Andrés Peña Maldonado
- Rugby masculino: D. Angel Bermúdez Caballero
- Senderismo: Dña. Margalida Perelló Maura y D. Jorge Lara Abelenda
- Tenis: D. José Illana Lope
- Tenis-mesa: D. Nasar Soulman-Riffi Pou
- Voleibol femenino: Dña. María del Carmen Latorre Flores
- Voleibol masculino: D. Alejandro Cruz Merino
Granada, 1 de octubre, 2020.